1、在结构和材料上不同，混合式电机内部具有永久磁性材料，故混合式电机有自阻（即在电机未加电的情况下有一定的自锁力），而反应式电机没有自阻。
2、在运行性能上有差别，混合式电机运行时相对较平稳，输出力矩相对较大，运行声音小。
3、两种电机在价格上有差别，反应式电机相对混合式电机而言要便宜。
反应式步进电机采用高导磁材料构成齿状转子和定子，其结构简单，生产成本低，步距角可以做的相当小，但动态性能相对较差，转矩较小。

混合式步进电机是指混合了永磁式和反应式的优点。其转子采用齿状的稀土永磁材料，定子则为齿状的突起结构。步距角小，出力大，动态性能好，是性能较好的一类步进电动机，目前市场上多用此类电机。运控公司生产的全部是混合式步进电机，尤其向用户推荐三相混合式步进电机，三相混合式步进电机抖动小，噪音低，精度高，性价比高。最受欢迎的是两相混合式步进电机，约占97%以上的市场份额，其原因是性价比高，配上细分驱动器后效果良好。该种电机的基本步距角为1.8°/步，配上半步驱动器后，步距角减少为0.9°，配上细分驱动器后其步距角可细分达256倍（0.007°/微步）。由于摩擦力和制造精度等原因，实际控制精度略低。同一步进电机可配不同细分的驱动器以改变精度和效果。